Приведем пример подготовки набора данных, обогащенного клинической информацией, следуя настоящим методическим рекомендациям.
Этап 1 – инициирование
На этапе инициирования была определена цель – подготовить НД, обогащенный клинической информацией, для научных целей, а также для тестирования ПО на основе ТИИ, оценивающего не только маммографические изображения, но и клиническую информацию. Стратегия – обогатить существующий НД, содержащий маммографические изображения с наличием и отсутствием признаков ЗНО молочной железы [19].
Этап 2 – планирование
На этапе планирования было подготовлено ТЗ. Объем выборки был определен исходным НД, содержащим исследования 100 пациентов.
По результатам литературного анализа был сформирован список клинических параметров для обогащения. Он включал: возраст пациентов на момент проведения исследования, возраст наступления менархе, возраст наступления менопаузы, количество родов, возраст первых родов, наличие и продолжительность лактации, использование заместительной гормональной терапии, ИМТ, онкологический анамнез, мутации в генах BRCA1, BRCA2, курение, злоупотребление алкоголем и другое.
Этап 3 – формирование
Был произведен сбор клинической информации из МИС и обработка данных – параметры, заполненные менее чем на 30 %, были исключены (согласно ТЗ). Результат этапа – таблица разметки, дополненная клиническими признаками (рисунок 13).
&hide_Cookie=yes)
Рисунок 13 – Фрагмент полученной таблицы разметки, дополненной клиническими признаками
Подготовлен readme-файл (см. рисунок 12).
Далее НД был оформлен в реестре НД и зарегистрирован – получено свидетельство о государственной регистрации базы данных [20].
Таким образом, процесс подготовки НД, обогащенного клинической информацией, можно представить в виде схемы (рисунок 14).
&hide_Cookie=yes)
Рисунок 14 – Схема процесса подготовки НД, обогащенного клинической информацией