Критерием оценки кишечной микробиоты здоровых взрослых людей в возрасте от 19 до 65 лет с нормальным ИМТ, потребляющих сбалансированные по энергетической и пищевой ценности рационы, адекватные возрасту и энерготратам, является комплекс таксономических, популяционных, иммунометаболических характеристик микробного сообщества (табл. 25), значения которых определяются в кале [63, 64, 84, 93–103].
| № | Показатели | Значения |
| Таксономические и популяционные характеристики |
| 1 | Метагеномная характеристика сообщества в ранге филумов (филотипов); соотношение в ДНК, выделенной из содержимого кишечника, % | Наличие 7 основных филотипов Firmicutes, Bacteroidetes, Actinobacteria, Proteobacteria, Verrucomicrobia, Fusobacteria, Euryarchaeota (Methanobacteraeota) Соотношение Bacteroidetes : Firmicutes (индекс B / F) – 1,7—6,0 |
| 2 | Наличие в составе микробиоты представителей основного микробиома (таксонов в ранге рода и вида, % и диапазон содержания, lg КОЕ/г кала) соотношение в ДНК, выделенной из содержимого кишечника (индекс Bfr / Fprau) | Роды и виды Bifidobacteria, Atopobium, Lactobacillus, Bacteroides spp., в т. ч. B. fragilis, Bacteroides thetaiotaomicron, Parabacteroides, Prevotella, Alistipes spp., Faecalibacterium prausnitzii, Blautis, Dorea, Ruminococcus, Roseburia, Coprococcus, Clostridium spp. (кроме C. perfringens, C. botulinum), Lachnobacterium, Anaerostipes, Enterococcus, Escherichia coli, Akkermansia spp., Methanobrevibacter smithii) Соотношение видов Bacteroides fragilis : Faecalibacterium prausnitzii – не более 1,3 |
| 3 | Встречаемость условнопатогенных и патогенных микроорганизмов (% и диапазон содержания, lg КОЕ/г кала) | Не должны присутствовать: C. difficile, Salmonella spp., Shigella spp., Klebsiella spp., Pseudomonadaceae, Staphylococcus aureus, Bacillus cereus, Campylobacter coli & jejuni & lari, Helicobacter pylori, Listeria monocytogenes; |
| | | Могут выделяться транзиторно: Fusobacterium spp., Candida spp., в количестве не более 4 |
| 4 | Уровень ά-разнообразия (число видов кишечной микробиоты индивида) | Индекс Пиелу – более 0,4 |
| Показатели активности защитных и факультативных популяций (маркеры антагонизма) |
| 5 | Кислотообразование у бифидобактерий (ед. рН в среде культивирования первой генерации) | Не более 4,5 |
| 6 | Гемолитическая активность аэробных и анаэробных микроорганизмов, % | Число КОЕ с признаками гемолиза эритроцитов в среде культивирования – менее 10 % от общего количества КОЕ/г кала |
| Иммунологические и метаболические характеристики копрофильтрата |
| 7 | Содержание КЦЖК, в том числе ацетата (А), пропионата (П), бутирата (Б) | мМоль/л, Σ | соотношение А : П : Б |
| 50—150 | 3 : 1 : 1 |
| 8 | концентрация аммиака фекальные аминокислоты и их производные, частота обнаружения, %, не более | β-аспартилглицин γ-аминоуксусная β-аспартиллизин β-аланин 5-аминовалериановая γ-аминоизомасляная | 0 0 0—10 0—5 0—10 0—10 |
| 9 | Концентрация секреторного IgA, мг/л | в пределах 0—50 |
| 10 | Суммарная антилизоцимная, антииммуноглобулиновая и антиинтерфероновая активности (индекс ингибирования тест-культур, частота обнаружения, %) |
| 11 | Кислотность содержимого толстой кишки, ед. рН | от 7,0 до 7,5 |